Résumé | Les diagnostics moléculaires établissent la manière dont les gênes et les protéines interagissent dans les cellules et ils portent essentiellement sur les modèles d'activité des gênes et des protéines dans divers types de cellules cancéreuses ou précancéreuses. Les diagnostiques moléculaires relèvent ces ensembles de changements et saisissent cette information sous forme de modèles d'expression au moyen de diverses techniques d'analyse de données. Plusieurs facteurs nuisent à l'exactitude du processus diagnostique, comme la qualité des échantillons biologiques, la précision des méthodes analytiques et la qualité des sondes du microréseau.Alors qu'il est possible de traiter les deux premiers facteurs en faisant appel à de meilleures techniques de stockage des échantillons, à une manipulation plus soignée des échantillons, et en choisissant avec soin des techniques analytiques ayant de plus larges domaines d'application et des degrés d'exactitude supérieurs, le troisième facteur est, le plus souvent, plus difficile à ajuster en raison de la rigidité des plateformes à microréseau actuelles et à l'augmentation des coûts liée à leur reconception et à leur revalidation. Nous présentons ici une technique qui permet aux chercheurs d'utiliser des données expérimentales (valeurs d'expression) obtenues au moyen de plateformes de microréseau dont les ensembles de sondes peuvent ne pas correspondre à l'information biologique connue à l'heure actuelle. Cette technique est en mesure d'ajuster les valeurs d'expression des données expérimentales en détectant les irrégularités entre sondes et en estimant leur degré d'hybridation au moyen de la modélisation thermodynamique moléculaire. |
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